二者在含义不同、侧重表达不同、详细解释不同，具体如下：

一、含义不同

1、质疑是指对某一事件问题提出疑问。

2、否认是指对某一事件或问题持不承认的态度。

二、侧重表达不同

1、质疑侧重心有所疑问，提出以求能得到解答。

2、否认侧重表不承认的态度。

三、详细解释不同

1、质疑主要是疑问、疑惑，提出疑难问题。

2、否认主要是不承认，矢口否认。